Устойчивость к антибиотикам была определена как одна из самых больших глобальных угроз здоровью. Из-за распространения устойчивости к антибиотикам все большее число инфекций, таких как пневмония и туберкулез, становится все труднее лечить. Длительное пребывание в больницах, увеличение расходов и рост смертности – вот некоторые из последствий устойчивости к антибиотикам. Однако новое исследование, опубликованное в журнале eLife, показало, что потребление антибиотиков не является основным фактором распространения устойчивости к аминогликозидам. Напротив, распространение устойчивости к антибиотикам по Европе в период с 1997 по 2018 год в основном объясняется обменом между экосистемами, например, импортом товаров или путешествиями.
Исследование предполагает, что одного только сокращения потребления антибиотиков может быть недостаточно, чтобы остановить распространение генов устойчивости к антибиотикам среди бактериальных популяций. Вместо этого интервенционные стратегии должны быть направлены на контроль обмена, особенно между экосистемами.
Аминогликозиды – это класс антибиотиков, которые имеют ограниченное клиническое применение у людей, но широко используются для лечения сельскохозяйственных животных. Их устойчивость представляет собой значительную угрозу для глобальной продовольственной безопасности. Исследование, проведенное Леа Прадье, бывшей аспиранткой Университета Монпелье, Франция, и Стефани Бедхомм, научным сотрудником CNRS, было посвящено генетическому, географическому и экологическому распределению устойчивости к аминогликозидам. На основе этой информации в исследовании был определен относительный вклад различных факторов, способствующих распространению устойчивости к антибиотикам.
Исследователи использовали вычислительный подход для анализа генетической информации более 160 000 бактериальных геномов в поисках генов, кодирующих ферменты, модифицирующие аминогликозиды (AME) – наиболее распространенный механизм устойчивости к аминогликозидам. Они обнаружили гены AME примерно в четверти проверенных геномов, в образцах со всех континентов (за исключением Антарктиды) и во всех исследованных биомах. Большинство бактерий, несущих гены AME, были обнаружены в клинических образцах (55,3%), образцах людей (22,1%) и фермерских образцах (12,3%).
Затем исследование сосредоточилось на распространении генов АМЕ по всей Европе в период с 1997 по 2018 год, когда были доступны наиболее подробные данные. В течение этого периода использование аминогликозидов оставалось относительно постоянным, но сильно различалось между странами. Сравнивая распространенность генов AME между странами с разным использованием аминогликозидов с течением времени, группа исследователей определила, что потребление аминогликозидов было лишь незначительным объясняющим фактором, с небольшим положительным или направленным влиянием на распространенность генов AME.
Вместо этого, обмен между людьми посредством торговли и миграции, а также обмен между биомами, объясняет большую часть распространения и поддержания устойчивости к антибиотикам при моделировании во времени, пространстве и экологии. Гены АМЕ могут переноситься через континенты с продуктами растительного и животного происхождения, международной торговлей и путешественниками. Затем они могут распространяться среди местных штаммов бактерий посредством горизонтального переноса генов – перемещения генетической информации между организмами. Пул генов АМЕ, отобранных из растений, диких животных и почвы, имел самое сильное совпадение с другими сообществами, что позволяет предположить, что эти биомы являются основными центрами распространения генов АМЕ либо путем горизонтального переноса генов устойчивости, либо путем перемещения устойчивых бактерий.
Исследование позволяет предположить, что основная причина распространения генов АМЕ – перемещение устойчивых к антибиотикам бактерий между экосистемами и биомами. Этому распространению способствуют мобильные генетические элементы, которые увеличивают вероятность того, что геном несет несколько копий одного и того же гена AME. Это увеличивает экспрессию переданных генов AME и позволяет бактериям развивать новые функции устойчивости к антибиотикам через дублированные последовательности.
Полученные результаты имеют важное значение для политики общественного здравоохранения, направленной на борьбу с устойчивостью к антибиотикам. Результаты показывают, что интервенционные стратегии, основанные только на сокращении использования антибиотиков, могут оказаться недостаточными для сдерживания распространения генов устойчивости к антибиотикам. Напротив, исследование предполагает, что более комплексный подход к контролю обмена между экосистемами, такими как товарные

Исследование предполагает, что одного только сокращения потребления антибиотиков может быть недостаточно, чтобы остановить распространение генов устойчивости к антибиотикам среди бактериальных популяций. Вместо этого интервенционные стратегии должны быть направлены на контроль обмена, особенно между экосистемами.

Аминогликозиды – это класс антибиотиков, которые имеют ограниченное клиническое применение у людей, но широко используются для лечения сельскохозяйственных животных. Их устойчивость представляет собой значительную угрозу для глобальной продовольственной безопасности. Исследование, проведенное Леа Прадье, бывшей аспиранткой Университета Монпелье, Франция, и Стефани Бедхомм, научным сотрудником CNRS, было посвящено генетическому, географическому и экологическому распределению устойчивости к аминогликозидам. На основе этой информации в исследовании был определен относительный вклад различных факторов, способствующих распространению устойчивости к антибиотикам.

Исследователи использовали вычислительный подход для анализа генетической информации более 160 000 бактериальных геномов в поисках генов, кодирующих ферменты, модифицирующие аминогликозиды (AME) – наиболее распространенный механизм устойчивости к аминогликозидам. Они обнаружили гены AME примерно в четверти проверенных геномов, в образцах со всех континентов (за исключением Антарктиды) и во всех исследованных биомах. Большинство бактерий, несущих гены AME, были обнаружены в клинических образцах (55,3%), образцах людей (22,1%) и фермерских образцах (12,3%).

Затем исследование сосредоточилось на распространении генов АМЕ по всей Европе в период с 1997 по 2018 год, когда были доступны наиболее подробные данные. В течение этого периода использование аминогликозидов оставалось относительно постоянным, но сильно различалось между странами. Сравнивая распространенность генов AME между странами с разным использованием аминогликозидов с течением времени, группа исследователей определила, что потребление аминогликозидов было лишь незначительным объясняющим фактором, с небольшим положительным или направленным влиянием на распространенность генов AME.

Вместо этого, обмен между людьми посредством торговли и миграции, а также обмен между биомами, объясняет большую часть распространения и поддержания устойчивости к антибиотикам при моделировании во времени, пространстве и экологии. Гены АМЕ могут переноситься через континенты с продуктами растительного и животного происхождения, международной торговлей и путешественниками. Затем они могут распространяться среди местных штаммов бактерий посредством горизонтального переноса генов – перемещения генетической информации между организмами. Пул генов АМЕ, отобранных из растений, диких животных и почвы, имел самое сильное совпадение с другими сообществами, что позволяет предположить, что эти биомы являются основными центрами распространения генов АМЕ либо путем горизонтального переноса генов устойчивости, либо путем перемещения устойчивых бактерий.

Исследование позволяет предположить, что основная причина распространения генов АМЕ – перемещение устойчивых к антибиотикам бактерий между экосистемами и биомами. Этому распространению способствуют мобильные генетические элементы, которые увеличивают вероятность того, что геном несет несколько копий одного и того же гена AME. Это увеличивает экспрессию переданных генов AME и позволяет бактериям развивать новые функции устойчивости к антибиотикам через дублированные последовательности.

Полученные результаты имеют важное значение для политики общественного здравоохранения, направленной на борьбу с устойчивостью к антибиотикам. Результаты показывают, что интервенционные стратегии, основанные только на сокращении использования антибиотиков, могут оказаться недостаточными для сдерживания распространения генов устойчивости к антибиотикам. Напротив, исследование предполагает, что более комплексный подход к контролю обмена между экосистемами, такими как товарные